Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tubb1A2AQ07 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tubb1A2AQ07 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms