Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Top3bQ9Z321 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Top3bQ9Z321 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Top3bQ9Z321 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Top3bQ9Z321 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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