Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms