Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Syngr4Q9Z1L2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms