Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Cldn15Q9Z0S5 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cldn15Q9Z0S5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms