Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clip2Q9Z0H8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms