Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms