Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prkab1Q9R078 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prkab1Q9R078 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms