Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf4Q9QZS2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf4Q9QZS2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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