Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rdh11Q9QYF1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms