Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rabgef1Q9JM13 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rabgef1Q9JM13 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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