Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Col5a3Q9JLI2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col5a3Q9JLI2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col5a3Q9JLI2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col5a3Q9JLI2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Col5a3Q9JLI2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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