Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lmbr1Q9JIT0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lmbr1Q9JIT0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms