Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
OtofQ9ESF1 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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