Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ndufs3Q9DCT2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms