Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Capns2Q9D7J7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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