Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ttc9bQ9D6E4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ttc9bQ9D6E4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms