Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gcc1Q9D4H2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms