Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdm1Q9CQK3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms