Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Chmp3Q9CQ10 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Chmp3Q9CQ10 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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