Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Pacsin3Q99JB8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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