Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Atg5Q99J83 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms