Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sf3b5Q923D4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms