Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tubb6Q922F4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms