Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Uhrf1Q8VDF2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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