Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf183Q8QZS5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rnf183Q8QZS5 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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