Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ssh3Q8K330 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ssh3Q8K330 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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