Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gtf3c1Q8K284 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gtf3c1Q8K284 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gtf3c1Q8K284 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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