Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
SbsnQ8CIT9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SbsnQ8CIT9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms