Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc113Q8C5T8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ccdc113Q8C5T8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc113Q8C5T8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc113Q8C5T8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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