Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vash1Q8C1W1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms