Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kdm4aQ8BW72 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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