Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx17Q8BVL3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx17Q8BVL3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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