Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Ubash3bQ8BGG7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ubash3bQ8BGG7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ubash3bQ8BGG7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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