Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZQ7

BC048562, cDNA sequence BC048562, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048562Q80ZQ7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
BC048562Q80ZQ7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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BC048562Q80ZQ7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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