Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ttc28Q80XJ3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms