Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Actn1Q7TPR4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms