Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tmeff1Q6PFE7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms