Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Msi1Q61474 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Msi1Q61474 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms