Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

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Length 706 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Mre11Q61216 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mre11Q61216 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms