Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc1Q5NCF2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms