Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

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Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Spire1Q52KF3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Spire1Q52KF3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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