Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TraddQ3U0V2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TraddQ3U0V2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms