Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccbe1Q3MI99 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccbe1Q3MI99 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccbe1Q3MI99 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms