Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
NrepQ07475 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
NrepQ07475 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms