Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 4930599N24Rik-201ENSMUST00000198822 1003 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Siah2Q06986 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms