Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snai1Q02085 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms