Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
EgfrQ01279 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
EgfrQ01279 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms