Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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SgcgP82348 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SgcgP82348 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SgcgP82348 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SgcgP82348 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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SgcgP82348 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SgcgP82348 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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