Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms